اشکال در آدرس دهی

با سلام
دوستان من سایتی دارم که آپلودش کردم

توی آدرس دهی فایل ها یه مقدار گیج شدم

ساختار رو اینجا میذارم و توضیح میدم که چیکار کردم برای آدرس دهی تا شما هم بدونید میخوام چیکار کنم

ساختار پوشه ها به صورت زیر است:

پوشه ها هم که تقریبا مشخصه برای چه کاریه

یه دونه فایل توی روت دارم به اسم not_found.php که برای کنترل خطای 404 و اینجور خطاهاست.

این فایل یه استایلی داره که با فایلهای css استایلش درست میشه
با آدرس site.ir/not_found.php میشه بهش دسترسی داشت.

حالا اگه من با آدرس site.ir/dfkjsdf.php یک آدرس الکی بزنم این صفحه با تنظیماتی که در فایل htaccess انجام دادم نمایش داده خواهد شد.
ولی اگه یک آدرس الکی به این صورت site.ir/phpfiles/sdflksjdf.php وارد کنم همین صفحه نشون داده میشه ولی استایلی نداره. مثل اینکه فایلهای css رو نمیشناسه.

و اگه فایلهای css رو به صورت آدرس دهی absolute آدرس دهی کنم یعنی به این صورت http://site.ir/css/style.css لود شدن سایت خیلی طول میکشه.

یک مثال دیگه که بخوام بزنم اینه که من توی سایتم یک فوتر دارم که داخلش یک فایل دیگه که مخصوص آمارگیری از بازدید های سایت هستش اینکلود میشه و وقتی داخل زیر پوشه ها میخوام همین فایل رو اینکلود کنم آدرس رو نمیشناسه.
اگه امکانش هست دوستان راهنمایی کنند من باید چطوری آدرس دهی کنم؟

php مرکز کد های سایت...